Toxico-Informatics

환경위해물질 특성 평가 및 인간 위해성평가 단백체 및 유전체 지표 발굴

유전체연구팀

환경독성물질유전체지표발굴

  • 혈구세포주유전체지표발굴
    • T-lymphocyte(혈구세포주)
    • 다이옥신(TCDD&PCDF)
    • PAH (B[a]P&B[a]A)
  • 동물혈구유전체지표발굴
    • 다이옥신(TCDD&PCDF)
    • PAH(B(a)P&B(a)A)
  • 인간혈구유전체지표발굴
    • 다이옥신(소각장근로자)
    • PAH(자동차검사원)

단백체연구팀

환경독성물질단백체지표발굴

  • 간암 세포주 분비 단백체 지표발굴
    • HepG2(간암세포주)
    • 다이옥신(TCDD&PCDF)
    • PAH (B[a]P&B[a]A
  • 동물혈장단백체지표발굴
    • 다이옥신(TCDD&PCDF)
    • PAH (B[a]P&B[a]A
  • 인간혈장단백체지표발굴
    • 다이옥신(소각장근로자)
    • PAH(자동차검사원)

생물정보학팀

DB구축과 QSTR

  • 데이터 수집 및 통합적 환경독성 데이터베이스 모델링
  • 데이터 표준화 작업 및 생물정보학을 이용한 분석도구 개발, 통합형 인터페이스 구축
  • 데이터 수집 및 유전체/단백체 발현정보 기반의 QSTR 모델 알고리즘 개발
  • 통합 환경독성 DB 검증 프로토타입의 유전체, 단백체 발현정보 기반 QSTR 모델 확립 및 검증

환경 독성 화합물 DB

Chemical Compound

  • Dioxin : 218개
    • PCDD : 75개
    • PCDF : 135개
    • PCB : 8개
  • PAH : 30개
  • 기타 화합물 : 136,771개

환경 독성 실험 결과 DB

Bioassay Information

  • Toxicity Study
    • Study : 14개
    • Study experiment : 15,372개

환경 독성 실험 문헌 DB

Literature

  • 2000년~2007년 수집 abstracts : 16,595개

화합물 연관 정보 DB

Chemical Compound relation information

  • Gene
    • number of Gene : 391,210개
    • Relation between gene and chemical compound : 236,226개
  • Protein
    • number of Protein : 466,739개
    • Relation between protein and chemical compound : 106,626개
  • Disease
    • number of Disease : 7,155개
    • Relation between disease and chemical compound : 424,266개

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